根据2014年贵阳市生物资源多样性专项调查结果，贵阳市共有维管束植物（蕨类植物、裸子植物、被子植物）和脊椎动物（鸟类、两栖类、爬行类、兽类、鱼类）3016种。其中，维管束植物2597种，分属204科，889属，其中蕨类植物36科，79属，218种；裸子植物7科，13属，23种；被子植物161科，797属，2356种；被子植物中双子叶植物为：138科，605属，1903种，单子叶植物23科，192属，453种。有古树大树及名木共3773株，古茶树1364株，其中Ⅱ级古茶树1株。从分布区域来看，开阳县有古茶树3株，花溪区有古茶树1361株，其余区县无古茶树。有脊椎动物419种，分别是：兽类46种，分属7目15科；鸟类259种，分属18目，58科；爬行类30种，分属2目7科；两栖类16种，分属2目8科；鱼类68种，分属5目13科。

从重点保护物种来看，贵阳市共有国家Ⅰ级保护植物8种，分别是：伯乐树、珙桐、光叶珙桐、银杏、云贵水韭、水杉、红豆杉和南方红豆杉，国家Ⅱ级保护植物15种，有国家Ⅰ级保护动物1种，为黑鹳，国家Ⅱ级保护动物32种。其中兽类2种；鸟类29种；两栖类1种。

依据《中国生物多样性红色名录—高等植物卷》评估报告，贵阳市维管束植物有受威胁种95种，占贵阳市维管束植物总数的3.66%。其中，极危(CR)等级的有6种，占总统计数的0.23%；濒危(EN)等级的有20种，占总统计数的0.77%；易危(VU)等级的29种，占总统计数的1.12%。根据已颁布的国家重点保护野生植物名录（第一批），贵阳市维管束植物有23种进入该保护名录，占贵阳市维管束植物总数的0.88%。其中，Ⅰ级保护8种，占贵阳市维管束植物总数的0.31%，Ⅱ级保护15种，占贵阳市维管束植物总数的0.58%。

依据IUCN红色名录（2014.2），贵阳市脊椎动物有受威胁种17种，占总物种数的4.08%。其种类和受威胁等级分别是：近危（NT）鸟类4种；濒危（EN）两栖类2种、易危(VU) 两栖类1种、近危(NT) 两栖类1种； 濒危（EN）爬行类1种、易危(VU) 爬行类1种；极危(CR) 鱼类1种、易危(VU) 鱼类2种、近危(NT) 鱼类1种；近危（NT）兽类3种。依据国家重点保护野生动物名录，贵阳市脊椎动物有32种进入名录，占总物种数的7.67%。种类和濒危等级分别是：国家Ⅰ级保护鸟类1种、国家Ⅱ级保护鸟类29种；国家Ⅱ级保护两栖动物1种；国家Ⅱ级保护兽类1种。